השרות פועל מתוקף החוק לפיקוח על יצוא הצמח ומוצריו - 1954
והתקנות לחוק זה. השרות ניתן לכל תוצרת ממקור צמחי המיועדת
ליצוא: הדרים, אתרוגים (ארבעת המינים), פרחים, פירות, ירקות,
תבלינים טריים, אגוזי אדמה וגרעיני חמניות. הביקורת נעשית
באמצעות מדגם אקראי של משלוח בתחנות אריזה, בתחנות מעבר
(טרנזיט) ובמסופי היצוא, הכל לפי העניין.
לשרותים להגנת הצומח ולביקורת הסכם הדדיות עם האיחוד האירופי
בנושא פיקוח על תוצרת טרייה ועל תוצרת אורגנית. התעודות
הבינלאומיות המונפקות ע"י השרות לביקורת תוצרת חקלאית
מוכרות ע"י האיחוד האירופי, דבר המקל במידה רבה על כניסת
תוצרת ישראל לאירופה.
השרות פועל גם מתוקף הסכמים בינלאומיים נוספים המאפשרים
יצוא בתנאים מיוחדים, כגון טיפולי מניעה והכחדה של מזיקים ומחלות,
בדרך כלל באמצעות טיפולי-קור. טיפולים אלו נדרשים ע"י מדינות
מייבאות כגון, יפן, דרום קוריאה, ארה"ב ואוסטרליה. השרות פועל
כנאמן לביצוע דרישות המדינות המייבאות על פי תנאי ההסכם.
תוצרת שנבדקה ואושרה ליצוא זכאית לקבל על פי העניין תעודות
בינלאומיות המעידות על כך ומלוות את התוצרת ליעדה. התעודות
הבינלאומיות הן תעודת ביקורת איכות, תעודת בריאות ותעודה
לתוצרת אורגנית.השרותים להגנת הצומח ולביקורת הוא הגוף הרשמי
המוסמך להנפיק תעודות אלו המוכרות ע"י השלטונות במדינות היעד
של היצוא החקלאי הישראלי.
השרות הוא מגוון וניתן בפריסה ארצית רחבה, במסופי היצוא,
בבתי אריזה/תחנות מעבר או במקום אחר, על פי בקשת מבקש
השרות ותמורת תשלום.