תהליך הרישום כולל  את השלבים הבאים:
א)  עריכת ניסויים בתכשיר – לעריכת ניסויים בתכשיר חדש יש לקבל את אישור מנהל 
השרותים להגנת הצומח ולביקורת. קבלת ההיתר מותנית בהגשת טופס בקשה לעריכת 
ניסויים, הגשת מסמכים כנדרש בטופס הבקשה ובתשלום אגרה, אשר יוגשו למחלקה 
לתכשירי הדברה למרכז ניסויי השדה.
ב) דיון בועדה ביולוגית  (ועדת תכשירים)– ועדת מומחים המייעצת למנהל השרותים
להגנת הצומח ולביקורת, דנה בראיות המבוססות על ניסויי שדה  והמוכיחות  את יעילות
ההדברה  ובטיחות התכשיר בכל צירוף של  נגע גידול. 
ראה קריטריונים להגשת תיק יעילות בסעיף נהלים.
המעוניין להרשם לדיון בועדה הביולוגית יגיש טופס בקשה בצרוף תשלום אגרת בקשה.
ראה תעריפי אגרות בסעיף פרסומים.
ג) ועדה טוקסיקולוגית (בין משרדית) – ועדה הדנה בבטיחות התכשיר לאדם, לחי
ולסביבה . דיון בועדה זו מותנה בהמלצת הועדה הביולוגית לשימוש בתכשיר.
לדיון בועדה יש להגיש טופס בקשה.
ראה קריטריונים להגשת תיק טוקסיקולוגי בסעיף נהלים.
ד) קביעת ימי המתנה (PHI - Post Harvest Interval) ושאריות מקסימליות מותרות  
MRL - Maximum Residue Limits בגידולים אכילים - מתבססים על   נתונים  
מתוך עקומות הדעיכה של התכשירים, אשר ניתנות לביצוע במעבדות השרותים להגנת 
הצומח ולביקורת או במעבדה מוכרת אחרת. 
ביצוע עקומות הדעיכה מותנה באישור ותאום מוקדם של תוכנית ניסויי השדה עם      
תחום כימיה (חומרי הדברה ומספוא).
ראה נוהל ניסויים מכוונים לביצוע עקומות דעיכה בסעיף נהלים.
ה) אישור תוית התכשיר – תוכן ומבנה התוית מוגדרים ע"י תקנות הגנת הצומח (יבוא 
ומכירה של תכשירים כימיים) התשנ"ה- 1994. התוית משקפת את ההמלצות השונות 
של הועדות המאשרות את התכשיר.
התוית מאושרת במחלקה לתכשירי הדברה, תחום כימיה.
ראה מבנה תוית לתכשיר הדברה בסעיף נהלים.
ו) רישום תכשיר והנפקת תעודת רישום – תכשיר שאושר ע"י הועדות, כולל מבנה התוית, 
תשולם עבורו אגרת רישום תכשיר (ראה בסעיף פרסומים), התכשיר יקבל מספר רשיון 
ותונפק עבורו תעודת רישום.
ז) הרחבת תוית של תכשיר רשום – על מנת להוסיף גידולים או נגעים חדשים לתוית של
תכשיר רשום יש לבצע את המפורט בסעיפים ב, ג, ה.
ח) חידוש רישום תכשיר – מתבצע פעם בשלוש שנים, כפי שמוגדר בתקנות. יש להגיש
טופס בקשה לחידוש רישום תכשיר (ראה טפסים) בצרוף תוית מעודכנת, דוגמאת
תכשיר, חומר טכני וסטנדרט אנליטי מלווה במסמכים המתאימים, ולשלם אגרה
(ראה אגרות ודמי שרות בסעיף פרסומים).
ט) ביטול תעודת רישום תכשיר – על מנת לבטל תעודת רישום של תכשיר הנמצא
ברשימת התכשירים המאושרים, על החברה בעלת תעודת הרישום  לפנות למחלקה
לתכשירי הדברה לקבלת הנחיות.